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DNA 测序揭示恶性肿瘤样本中的病毒成分

德国癌症研究中心的科学家系统地研究了来自 38 种癌症患者的 2600 多个肿瘤样本的 DNA,以发现病毒痕迹,他们在 13% 的研究样本中发现了病毒痕迹。研究人员还确定了病原体用来触发 DNA 致癌突变的机制。这项工作是全基因组泛癌分析 (PCAWG) 的一部分,该计划由国际癌症基因组联盟 (ICGC) 发起。

世界卫生组织 (WHO) 估计,超过 15% 的癌症直接或间接归因于传染性病原体。位于里昂的国际癌症研究机构 (IARC) 将 11 种不同的病原体(病毒、细菌和蠕虫)归类为致癌物,并估计十分之一的癌症与病毒有关。在全世界,每年共有 640,000 例癌症仅由人乳头瘤病毒 (HPV) 引起。

由德国癌症研究中心 (DKFZ) 的彼得·利希特 (Peter Lichter) 领导的国际基因组研究团队现已发表了一篇新论文,以准确概述哪些病毒在哪些癌症中发挥作用。研究人员还寻找以前与致癌作用无关的病毒,甚至是完全未知的病毒。

“哪些病毒与癌症有关的问题在医学上具有高度相关性,”本研究的主要作者 DKFZ 的 Marc Zapatka 解释道。“因为在与病毒相关的癌症中,真正的预防是可能的:如果确定了致癌病毒,就有可能避免感染疫苗,从而预防癌症的发展。”

目前的工作是全基因组泛癌症分析 (PCAWG) 的一部分,该联盟由 1,300 多名研究人员组成,他们合作确定哪些基因突变或 DNA 突变模式在几种类型的肿瘤中发挥作用。对于这项荟萃分析,他们对来自 38 种不同类型癌症的2,600 多个肿瘤基因组的测序数据进行了全面的生物信息学分析。

DFKZ 团队在 356 名癌症患者身上发现了总共 23 种不同病毒类型的痕迹。正如预期的那样,已知的肿瘤发生和生长的病毒驱动因素是最常见的:已知会导致多种不同类型癌症的爱泼斯坦-巴尔病毒 (EBV) 的基因组,尤其是淋巴瘤、胃癌和鼻咽癌,在调查的癌症基因组中有 5.5% 被发现。在 330 例肝癌病例中的 62 例中发现了乙型肝炎病毒 (HBV) DNA。

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